Водоем расположен в 47 км северо-восточнее Полоцка и относится к бассейну реки Полота. Ближайшим населенным пунктом является деревня Большое Ситно, которая находится в 2,5 км от юго-западного берега. Площадь водного зеркала составляет 0,04 км2.
Озеро Пустое окружено грядово-холмистой местностью, которая представляет собой частично заболоченный лесной массив. Для него характерны песчаные возвышенные берега и умеренная степень зарастания.
Здесь обитают щука, лещ, красноперка и другие виды. Поскольку данный водоем является частью Республиканского ландшафтного заказника «Глубокое – Большое Островито», при его посещении запрещено наносить ущерб какой-либо природе.