Синагога была построена в деревне Лужки в середине XIX века из кирпича и бутового камня на высоком склоне реки Мнюты. При синагоге до 1930-х годов действовал хедер — начальная еврейская религиозная школа.

В этом хедере учился уроженец Лужков Элиэзер Бен-Иегуда (настоящее имя Лейзер-Ицхок Перельман, 1858–1922) — основатель гербаизма, человек, посвятивший свою жизнь возрождению иврита в качестве современного разговорного языка. Бен-Иегуда умер в Иерусалиме, где в честь него названа одна из центральных улиц.