Возможно, Никольская церковь существовала в Брагине с XVII столетия, но точное время ее возведения неизвестно. В любом случае старый храм в городском поселке не сохранился — он был разрушен в 1936 году.
Новую церковь в Брагине начали строить в 1988 году. Внешне кирпичный храм на Октябрьской улице немного напоминает жилой дом. На то, что это православная святыня, указывают три небольших купола на крыше здания.