Этот водоем расположен в 22 км юго-западнее Полоцка и относится к бассейну реки Нача. Ближайшим населенным пунктом является д. Муравщина, примыкающая к южному берегу. Площадь водного зеркала составляет 0,08 км2.
Преимущественно высокие берега озера Боконьки покрыты лесом, к нему также примыкают сельскохозяйственные угодья. Имеется ручей, который соединяет этот водоем с расположенным поблизости озером Ракутино. Здесь обитают окунь, щука, лещ и другие виды.